Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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