Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNB1Q14721 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms