Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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