Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM25Q14258 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM25Q14258 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms