Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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