Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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