Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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