Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB40BQ12829 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB40BQ12829 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB40BQ12829 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB40BQ12829 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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