Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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