Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EP300Q09472 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms