Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms