Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms