Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX3P78415 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRX3P78415 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRX3P78415 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRX3P78415 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms