Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms