Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM193AP78312 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms