Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms