Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms