Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms