Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCBP4P57723 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms