Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME5P56597 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NME5P56597 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME5P56597 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms