Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EPHB3P54753 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms