Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKAA2P54646 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA2P54646 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA2P54646 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA2P54646 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA2P54646 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms