Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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