Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms