Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA4P43681 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms