Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGER3P43115 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms