Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms