Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms