Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMNB1P20700 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms