Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRHP20396 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRHP20396 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRHP20396 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRHP20396 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRHP20396 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms