Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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