Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF3P18847 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATF3P18847 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms