Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VCLP18206 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VCLP18206 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VCLP18206 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms