Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEFHP12036 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms