Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODC1P11926 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ODC1P11926 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms