Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms