Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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