Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MUSKO15146 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MUSKO15146 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MUSKO15146 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MUSKO15146 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms