Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBAG9O00559 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms