Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms