Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDR42E2A6NKP2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms