Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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