Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPDC1A2A3K4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPDC1A2A3K4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms