Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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