Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms