Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIMS3Q9UJD0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms