Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms