Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms