Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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