Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OXSMQ9NWU1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms